Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A3Q96HJ5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms