Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX27Q96GQ7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms