Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms