Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RMDN1Q96DB5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms