Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms