Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VOPP1Q96AW1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms