Protein–RNA interactions for Protein: Q96A25

TMEM106A, Transmembrane protein 106A, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106AQ96A25 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM106AQ96A25 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms