Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms