Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A3Q93084 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms