Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms