Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113Q902F9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms