Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CTTNBP2Q8WZ74 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CTTNBP2Q8WZ74 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms