Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf40Q8WZ69 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C11orf40Q8WZ69 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms