Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STAG1Q8WVM7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAG1Q8WVM7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAG1Q8WVM7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAG1Q8WVM7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAG1Q8WVM7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAG1Q8WVM7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAG1Q8WVM7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAG1Q8WVM7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAG1Q8WVM7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAG1Q8WVM7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAG1Q8WVM7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAG1Q8WVM7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAG1Q8WVM7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAG1Q8WVM7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG1Q8WVM7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms