Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEPDC1BQ8WUY9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms