Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC12Q8WUD4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms