Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX29Q8TEQ0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms