Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF3IP1Q8TDR0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms