Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX54Q8TDD1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX54Q8TDD1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms