Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GADD45GIP1Q8TAE8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GADD45GIP1Q8TAE8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms