Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms