Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms