Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAAF3Q8N9W5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms