Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZIC4Q8N9L1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms