Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBR7Q8N806 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBR7Q8N806 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR7Q8N806 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR7Q8N806 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR7Q8N806 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR7Q8N806 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms