Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SMIM20Q8N5G0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SMIM20Q8N5G0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SMIM20Q8N5G0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SMIM20Q8N5G0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SMIM20Q8N5G0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SMIM20Q8N5G0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SMIM20Q8N5G0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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