Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACE1Q8IYU2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACE1Q8IYU2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms