Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS3Q8IXF0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms