Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms