Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms