Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KSR1Q8IVT5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms