Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP4Q86YS3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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