Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG1Q86XK7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG1Q86XK7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms