Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms