Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3T8

ZFYVE16, Zinc finger FYVE domain-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE16Q7Z3T8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZFYVE16Q7Z3T8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZFYVE16Q7Z3T8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZFYVE16Q7Z3T8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms