Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms