Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms