Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFXL1Q6ZNB6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFXL1Q6ZNB6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFXL1Q6ZNB6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFXL1Q6ZNB6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFXL1Q6ZNB6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NFXL1Q6ZNB6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFXL1Q6ZNB6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NFXL1Q6ZNB6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFXL1Q6ZNB6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFXL1Q6ZNB6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFXL1Q6ZNB6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NFXL1Q6ZNB6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NFXL1Q6ZNB6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NFXL1Q6ZNB6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NFXL1Q6ZNB6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFXL1Q6ZNB6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms