Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNI2Q6ZMN8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms