Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAP2EQ6VUC0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAP2EQ6VUC0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms