Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINGO4Q6UY18 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms