Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCLAT1Q6UWP7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCLAT1Q6UWP7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms