Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms