Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKN3Q6P5Z2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms