Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDC4Q6P2E9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms