Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP1R18Q6NYC8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R18Q6NYC8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R18Q6NYC8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R18Q6NYC8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R18Q6NYC8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R18Q6NYC8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms