Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms