Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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LCN8Q6JVE9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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LCN8Q6JVE9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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LCN8Q6JVE9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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LCN8Q6JVE9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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LCN8Q6JVE9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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LCN8Q6JVE9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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LCN8Q6JVE9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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LCN8Q6JVE9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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LCN8Q6JVE9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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