Protein–RNA interactions for Protein: Q6IS24

GALNT17, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT17Q6IS24 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT17Q6IS24 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT17Q6IS24 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT17Q6IS24 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT17Q6IS24 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT17Q6IS24 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT17Q6IS24 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT17Q6IS24 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT17Q6IS24 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT17Q6IS24 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT17Q6IS24 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNT17Q6IS24 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms