Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRAMD4Q6IC98 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms